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非接觸DNA打斷儀|全基因組DNA樣品的超聲打斷

  實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?/strong>對(duì)全基因組DNA樣品進(jìn)行100-500bp區(qū)間的片段化處理
  
  實(shí)驗(yàn)設(shè)備:非接觸DNA打斷儀XM-M220(單槽)

非接觸DNA打斷儀

  基因組DNA樣品超聲打斷的實(shí)驗(yàn)步驟:
  
  1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機(jī)啟動(dòng),設(shè)置溫度為4℃。
  
  2.將每個(gè)0.2mL EP管加入130μL濃度為12ng/μL的全基因組DNA溶液。
  
  3.將2管裝好樣品的0.2mL EP管分別放入儀器的適配器當(dāng)中,其他空余的孔位由加同樣體積水的0.2mL EP管補(bǔ)齊。
  
  4.程序設(shè)置:溫度4℃,超聲工作時(shí)間20s 間隔時(shí)間10s,總時(shí)長分別為3分鐘和4分鐘。
  
  5.程序結(jié)束后,取出樣品使用毛細(xì)管電泳進(jìn)行基因組片段化檢測。
  
  打斷完的毛細(xì)管電泳檢測結(jié)果圖:

  1.程序設(shè)置:溫度4℃,超聲工作時(shí)間20s 間隔10s,總時(shí)長4分鐘
  
  2.平均片段大小:266 bp,99-503 bp區(qū)間占比 89.33%。
  
  實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):
  
  1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機(jī)啟動(dòng),設(shè)置溫度為4℃
  
  2.試用TPX材質(zhì)的EP管,管子的材質(zhì)影響超聲打斷效果。
  
  3.客戶在做實(shí)驗(yàn)時(shí)一定要讓跟隨著老師一起做實(shí)驗(yàn),不然后續(xù)結(jié)果不理想無法分析出原因。
  
  非接觸超聲波DNA打斷儀采用等溫、旋轉(zhuǎn)離心管及非接觸的方式對(duì)樣品進(jìn)行打斷勻漿和混合。通過球面固態(tài)超聲換能器將聲波以三維方式聚焦到樣本區(qū)域,聚焦聲波能夠以不同角度的能量輸入獲得良好的處理效果。

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小美超聲波打斷儀:FFPE和全血gDNA樣本的超聲打斷測試結(jié)果
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